提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
虎头局获得新一轮数千万融资,烘焙赛道能否回暖******
1月12日,第一财经记者从新中式点心品牌虎头局渣打饼行(下称“虎头局”)创始人方面了解到,公司已经获得新一轮融资,金额约数千万元,红杉资本和GGV纪源资本参投。
第一财经记者从虎头局相关人士独家获悉,在本次融资中,已签约的产业方不止一家,具体名字要在正式发布的时候才能披露,目前还有两三家其他资金方也在谈,预计年后可以做一个完整的正式发布。
虎头局距离上次获得融资已经时隔一年半。
2022年,资本市场对新兴烘焙品牌的关注已不如2021年。虎头局在2021年进行了2轮融资,背后的投资机构约7家,包括老虎环球基金、纪源资本、红杉基金等;另一烘焙品牌墨茉点心局在2020年和2021年共进行了5轮融资,背后的投资机构约8家,包括亚商资本、 华兴资本、美团龙珠等。
而在2022年,这两家曾被资本捧得红极一时的品牌,均未获得任何一笔新的投资。进入2023年,虎头局的本次融资算是烘焙界的“开门红”。
不过,前不久虎头局还被曝拖欠员工工资、供应商货款及装修款。2022年12月27日,虎头局回应第一财经记者:“为应对疫情影响,暂时性调整了部分非一线员工工资,占比较小。装修供应商因施工争议,正在协商尾款,将积极与供应商沟通。因阳性员工暴增,临时关闭部分办公室,员工可远程工作。公司经营正常,随着员工康复,短期内将回复常态。”
此外,2022年年底虎头局撤去了部分城市的门店,与此同时也准备开放加盟。
放眼烘焙赛道,与虎头局一样,无论是老牌子,还是新兴烘焙品牌,面对疫情的影响和资本的冷静,近一两年的日子都不是那么好过,或许本次虎头局的融资成功可以让行业看见一些复苏的迹象。